chore: update semantic index, agent configs, and app startup

.opencode/agents/python-coder.md

@@ -43,6 +43,21 @@ MANDATORY USE `skill({name="semantics-core"})`, `skill({name="semantics-contract
 15. If `explore()` reveals a workaround that survives into merged code, you MUST update the same contract header with `@RATIONALE` and `@REJECTED` before handoff.
 16. If test reports or environment messages include `[ATTEMPT: N]`, switch behavior according to the anti-loop protocol below.
 
+## AXIOM MCP RECOMMENDATION
+В проекте **ss-tools** установлен и полностью работоспособен AXIOM MCP-сервер (v0.3.1).
+**Используй axiom tools — они понимают GRACE-семантику проекта и работают через DuckDB-индекс (2543 контракта):**
+
+- **Поиск и навигация:** `axiom_semantic_discovery search_contracts` — найди контракт по ID, типу, сложности, файлу. Быстрее `grep`.
+- **Контекст зависимостей:** `axiom_semantic_context local_context` — получи код контракта + все его @RELATION-зависимости за один вызов.
+- **Валидация:** `axiom_semantic_validation audit_belief_protocol` — проверь, что контракты C4/C5 содержат все обязательные тэги.
+- **Модификация:** `axiom_contract_metadata update_metadata` — безопасно меняй метаданные контракта (создаётся checkpoint). `axiom_contract_patch simulate` — preview перед записью.
+- **Анализ влияния:** `axiom_semantic_validation impact_analysis` — покажи upstream/downstream зависимости контракта.
+- **Здоровье:** `axiom_semantic_context workspace_health` — orphans, unresolved relations, распределение по сложности.
+
+Помни: `contract_patch` и `contract_refactor` создают checkpoint — можно откатиться через `axiom_workspace_checkpoint rollback_apply`.
+
+---
+
 ## ss-tools Backend Scope
 You own:
 - FastAPI route handlers (`backend/src/api/`)